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政学系与北洋政府合作之所以加剧国民党内部矛盾，与当时国民党的理念、政学系的利益考量以及党内不同派系的立场等因素密切相关。
理念冲突
国民党自成立以来，秉持着民主革命的理念，旨在推翻封建军阀统治，建立民主共和制度。而北洋政府是旧军阀势力的代表，其统治具有浓厚的封建专制色彩。政学系与北洋政府合作，这一行为明显与国民党的革命理念背道而驰。例如，孙中山先生领导的国民党长期致力于北伐，以武力推翻北洋军阀政权，而政学系却与北洋政府往来密切，这种理念上的巨大分歧使得国民党内坚持革命理念的成员对政学系极为不满，从而引发了党内矛盾。
利益分歧
政学系在与北洋政府合作过程中，往往是出于自身利益的考虑。他们希望借助北洋政府的势力来获取政治资源和经济利益。然而，这种行为损害了国民党整体的利益。国民党内部的其他派系认为政学系为了私利牺牲了党的利益。比如在一些地方的政治安排上，政学系为了讨好北洋政府，可能会放弃国民党在当地的发展机会，这引起了其他派系的强烈反对，导致党内矛盾不断升级。
权力争夺
国民党内部存在着不同的权力派系，政学系与北洋政府合作的行为，在一定程度上改变了党内的权力格局。政学系通过与北洋政府的合作，获得了更多的政治资源和权力，这对其他派系的权力构成了威胁。其他派系为了维护自身的权力和地位，必然会对政学系进行抵制和反对。例如，在党内的决策过程中，政学系可能会因为与北洋政府的关系而影响决策的方向，这使得其他派系感到自身的话语权被削弱，进而加剧了党内的权力斗争和矛盾。
综上所述，政学系与北洋政府的合作，由于理念冲突、利益分歧和权力争夺等多方面原因，严重加剧了国民党内部的矛盾。